Od začátku pandemie hraje diagnostické testování zásadní roli při kontrole šíření SARS-CoV-2, viru, který způsobujeCOVID 19.Rychlé antigenní testyprováděné doma nebo v klinickém prostředí poskytují výsledky do 15 minut nebo méně.Čím dříve je člověk diagnostikován, tím dříve může vyhledat lékařskou pomoc a izolovat se od ostatních.Ale když se objeví nové varianty viru, tyto varianty nemusí být těmito testy detekovány.
Většina rychlých antigenních testů je navržena tak, aby detekovala SARS-CoV-2 nukleokapsidový protein nebo N-protein.Tento protein se hojně vyskytuje ve virových částicích a infikovaných lidech.Rychlá testovací sadas obvykle obsahují dvě různé diagnostické protilátky, které se vážou na různé části N proteinu.Když se protilátka naváže na protein N ve vzorku, objeví se na testovací soupravě barevná čára nebo jiný signál, který indikuje infekci.
Protein N se skládá ze 419 aminokyselinových strukturních jednotek.Kteroukoli z nich lze mutací nahradit jinou aminokyselinou.Výzkumná skupina vedená Ph.D.Philip Frank a Eric Ortlund z Emory University se rozhodli prozkoumat, jak tato změna jedné aminokyseliny ovlivňuje výkon rychlého antigenního testu.Použili techniku ​​zvanou skenování hlubokých mutací, aby současně vyhodnotili, jak každá mutace v proteinu N viru ovlivňuje vazbu na diagnostickou protilátku.Jejich výsledky byly zveřejněny v Cell 15. září 2022.
Vědci vytvořili komplexní knihovnu téměř 8 000 N proteinových mutací.Tyto varianty tvoří více než 99,5 % všech možných mutací.Poté vyhodnotili, jak každá varianta interagovala se 17 různými diagnostickými protilátkami používanými v 11 komerčně dostupných rychlých antigenních testech, včetně běžnýchdomácí soupravy.
Tým posuzoval, které mutace N-proteinu ovlivňují rozpoznávání protilátek.Na základě těchto informací vytvořili „profil únikové mutace“ pro každou diagnostickou protilátku.Tento profil identifikuje specifické mutace v proteinu N, které mohou ovlivnit schopnost protilátky vázat se na svůj cíl.Analýza ukázala, že protilátky používané v dnešních rychlých testech rozpoznávají a vážou všechny minulé i současné varianty SARS-CoV-2, které vyvolávají obavy a obavy.
Ačkoli několik diagnostických protilátek rozpoznává stejnou oblast proteinu N, vědci zjistili, že každá protilátka má jedinečný podpis únikových mutací.Vzhledem k tomu, že virus SARS-CoV-2 pokračuje v mutaci a generování nových variant, lze tato data použít k označení protilátek testovací sady, které může být nutné přehodnotit.
„Přesná a účinná identifikace infikovaných jedinců zůstává kritickou strategií pro zmírnění COVID-19 a naše studie poskytuje informace o budoucích mutacích SARS-CoV-2, které by mohly narušovat detekci,“ řekl Ortlund."Výsledky zde uvedené nám umožňují rychle se přizpůsobit tomuto viru, protože se stále objevují nové varianty, které představují bezprostřední klinické důsledky a důsledky pro veřejné zdraví."
Pozadí: Mutation Deep Scan detekuje únikové mutace v nukleokapsidě SARS-CoV-2 pomocí aktuálně dostupných rychlých antigenních testů.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA cell.2022 15. září;185(19):3603-3616.e13.Ministerstvo vnitra: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29. srpna 2022 PMID: 36084631.
Financování: National Institute for Biomedical Imaging and Bioengineering NIH (NIBIB), National Institute of Diabetes, Disgestive and Kidney Diseases (NIDDK) a National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID), American Heart Association.
NIH Research Matters je týdenní aktualizace klíčových zjištění výzkumu NIH přezkoumána odborníky z NIH.Vydává jej Kancelář pro komunikaci a veřejné záležitosti ředitele Státního zdravotního ústavu.